すでにアプリの開発を始めちゃってる状況からgithubへ登録しようとしてはまった。
最終的には、
1. githubからnew repositoryでアプリと同名のレポジトリ作成
2.開発中のアプリのソースを退避（アプリフォルダのリネーム）
3.$ git clone <url>
4.退避させたアプリのソースを新しく作成されたアプリフォルダへコピペ
5.$ git add .
6.$ git commmit -m 'first commmit'
7.$ git push -u origin master
これで無事登録完了。
